Otra forma de clasificar al manga es mediante la temática, estilo o gag que se utiliza como centro de la historia. Así, tenemos:
- Progresivo: animación hecha con propósito de emular la originalidad japonesa. Ejemplos: Serial Experiments Lain, Neon Genesis Evangelion, Paranoia Agent.
- Cyberpunk: la historia sucede en un mundo donde los avances tecnológicos toman parte crucial en la historia, junto con algún grado de desintegración o cambio radical en el orden social. Ejemplos: Ghost in the Shell, GUNNM, Full Metal Alchemist, Akira.
- Ecchi: es la pronunciación de la letra H en japonés, presentando situaciones eróticas o subidas de tono llevadas a la comedia. Ejemplos: Golden Boy, Vandread, Kiss×sis, To Love-Ru.
- Furry: significa peludo, conformado de Animales antropomórficos, que es la combinación de rasgos humanos y animales.
- Gekiga: término usado para los anime dirigidos a un público adulto, aunque no tiene nada que ver con el hentai. El término. literalmente. significa "imágenes dramáticas". Ejemplo: Omohide Poro Poro, Hotaru no Haka.
- Gore: anime literalmente sangriento. Ejemplos: Elfen Lied, Higurashi no Naku Koro ni, Gantz, Deadman Wonderland, Umineko no Naku Koro ni.
- Harem: muchas mujeres son atraídas por un mismo hombre. Ejemplos: Rosario + Vampire, To Love-Ru, Love Hina, Onegai☆Twins.
- Harem Reverso: muchos hombres son atraídos por una misma mujer. Ejemplo:Uta no Prince-sama, Starry Sky.
- Hentai: significa literalmente "pervertido", y es el anime pornográfico. Ejemplos: Stringendo, Bible Black, La Blue Girl y Hatsu Inu.
- Kemeno: humanos con rasgos de animales o viceversa. Ejemplo: Tokyo Mew Mew, Black Cat, Inuyasha.
- Mahō shōjo: magical girl, chica-bruja o con poderes mágicos. Ejemplos: Corrector Yui, Sailor Moon, Card Captor Sakura, Mahō Shōjo Lyrical Nanoha, Mahō shōjo Kamikaze kaitō Jeanne.
- Mecha: robots gigantes. Ejemplos: Gundam, Mazinger Z, Neon Genesis Evangelion, Code Geass.
- Meitantei: es una historia policíaca. Ejemplos: Detective Conan, Death Note.
- Victoriana Fantástica: la historia sigue a un chico/chica del Siglo XIX que normalmente tiene alguna relación con alguna organización religiosa o gubernamental y que se enfrenta a energías sobrenaturales. Ejemplos: D.Gray-man, Pandora Hearts, Kuroshitsuji.
- Victoriana Histórica: a diferencia de la fantástica, la histórica nos muestra sucesos que ocurrieron en el Siglo XIX, con un toque de romance o comedia. Ejemplos: Emma,Hetalia: Axis Powers.
- Realidad virtual: en este caso los protagonistas estan dentro de un videojuego online y siguen una historia que puede ir variando mucho. Ejemplos: .hack, Accel World, Sword Art Online.
- Juego de Supervivencia: este genero es bastante conocido y siempre tiene bastante gore. Las historias de este tipo tratan de varios personajes que por diversos motivos se ven obligados a participar en un juego de supervivencia ya sea matándose unos a otros o haciendo equipo con otros personajes. Ejemplos: Gantz, Mirai Nikki, Btooom!,Deadman Wonderland, Battle Royale.
- Romakome:: es una comedia romántica. Ejemplos: Lovely Complex, School Rumble, Love Hina, Mayoi Neko Overrun!.
- Sentai:: en anime, se refiere a un grupo de superheróes. Ejemplo: Cyborg 009.
- Shōjo-ai o Yuri: romance homosexual entre chicas. Se diferencian el primero del segundo en el contenido, ya sea explícito o no. Ejemplos: Shoujo Kakumei Utena, Strawberry Panic, Kannazuki no Miko, Yami to Bōshi to Hon no Tabibito.
- Shōnen-ai y Yaoi: romance homosexual entre chicos u hombres. Se diferencian el primero del segundo en el contenido, ya sea explícito o no. Ejemplos: Gakuen Heaven,Sekaiichi Hatsukoi, Junjō Romantica, Gravitation.
- Spokon: historias deportivas. Ejemplos: Kuroko no Basuke, Inazuma Eleven, The Prince of Tennis, Free!, Eyeshield 21, Slam Dunk, Supercampeones.
- Shota: romance homosexual o heterosexual entre niños menores, este también se puede dar entre un niño menor y un adulto. Ejemplos: Boku no Pico y Papa to Kiss in the Dark.
- Lolicon: romance homosexual o heterosexual entre niñas menores, este también se puede dar entre una niña menor y un adulto. Ejemplo: Kodomo no Jikan.
- Kinshinsōkan: Relaciones románticas/eróticas entre miembros de la misma familia. Ejemplos: Aki Sora, Papa to Kiss in the Dark, Yosuga no Sora, Oreimo.